MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Herpetosiphon aurantiacus DSM 785 plasmid pHAU01

Total Repeats: 6969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009973	CGCA	2	8	23	30	25 %	0 %	25 %	50 %	159901511
2	NC_009973	ACC	2	6	97	102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
3	NC_009973	ACC	2	6	106	111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
4	NC_009973	ACC	2	6	124	129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
5	NC_009973	CTA	2	6	180	185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901511
6	NC_009973	GCC	2	6	207	212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
7	NC_009973	TGG	2	6	214	219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
8	NC_009973	GCC	2	6	301	306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
9	NC_009973	GGA	2	6	387	392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901511
10	NC_009973	GAG	2	6	517	522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901511
11	NC_009973	GCA	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
12	NC_009973	CCA	2	6	596	601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
13	NC_009973	GCC	2	6	616	621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
14	NC_009973	CAAC	2	8	645	652	50 %	0 %	0 %	50 %	159901511
15	NC_009973	TGG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
16	NC_009973	TGCC	2	8	684	691	0 %	25 %	25 %	50 %	159901511
17	NC_009973	TGGC	2	8	699	706	0 %	25 %	50 %	25 %	159901511
18	NC_009973	ACC	2	6	794	799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
19	NC_009973	CAA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
20	NC_009973	GAC	2	6	862	867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
21	NC_009973	GTC	2	6	896	901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
22	NC_009973	CCT	2	6	953	958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901511
23	NC_009973	ATG	2	6	1001	1006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901511
24	NC_009973	GCAC	2	8	1027	1034	25 %	0 %	25 %	50 %	159901511
25	NC_009973	CAC	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
26	NC_009973	CGG	2	6	1107	1112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
27	NC_009973	AAC	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
28	NC_009973	GTC	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
29	NC_009973	CG	3	6	1244	1249	0 %	0 %	50 %	50 %	159901511
30	NC_009973	ACG	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
31	NC_009973	CCG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
32	NC_009973	GGC	2	6	1489	1494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
33	NC_009973	CTGC	2	8	1606	1613	0 %	25 %	25 %	50 %	159901511
34	NC_009973	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
35	NC_009973	GAC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
36	NC_009973	AGC	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901511
37	NC_009973	TCC	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901511
38	NC_009973	CCA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
39	NC_009973	CAA	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901511
40	NC_009973	GTC	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
41	NC_009973	GTC	2	6	1933	1938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
42	NC_009973	CGC	2	6	1978	1983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
43	NC_009973	CTT	2	6	2022	2027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901511
44	NC_009973	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901511
45	NC_009973	GGC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901511
46	NC_009973	AGGCCG	2	12	2249	2260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	159901511
47	NC_009973	CAC	2	6	2297	2302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
48	NC_009973	CCG	2	6	2312	2317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901511
49	NC_009973	GTC	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901511
50	NC_009973	CCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901511
51	NC_009973	ACG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009973	AC	3	6	2447	2452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009973	CGT	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009973	ACC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009973	CCA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009973	CGC	2	6	2569	2574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009973	ACG	3	9	2619	2627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009973	CAG	2	6	2632	2637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009973	TCG	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009973	ATC	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009973	ATC	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009973	ACC	2	6	2769	2774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009973	CTT	3	9	2777	2785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009973	GCT	2	6	2809	2814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009973	TCCC	2	8	2880	2887	0 %	25 %	0 %	75 %	159901512
66	NC_009973	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901512
67	NC_009973	GCT	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901512
68	NC_009973	CTCG	2	8	2956	2963	0 %	25 %	25 %	50 %	159901512
69	NC_009973	GAG	3	9	2971	2979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901512
70	NC_009973	CAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901512
71	NC_009973	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901512
72	NC_009973	CAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
73	NC_009973	GCC	2	6	3265	3270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901512
74	NC_009973	ACC	2	6	3290	3295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901512
75	NC_009973	CAGG	2	8	3352	3359	25 %	0 %	50 %	25 %	159901512
76	NC_009973	ATC	2	6	3386	3391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
77	NC_009973	ATC	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901512
78	NC_009973	GGC	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901512
79	NC_009973	GCGA	2	8	3425	3432	25 %	0 %	50 %	25 %	159901512
80	NC_009973	CGG	2	6	3563	3568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901513
81	NC_009973	CACGGC	2	12	3627	3638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159901513
82	NC_009973	CAG	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901513
83	NC_009973	CGACA	2	10	3687	3696	40 %	0 %	20 %	40 %	159901513
84	NC_009973	CAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901513
85	NC_009973	GGT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901513
86	NC_009973	CAG	2	6	3796	3801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901513
87	NC_009973	GGA	2	6	3981	3986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901513
88	NC_009973	CGA	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009973	CGG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009973	AAC	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009973	CGG	2	6	4088	4093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009973	AGC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901514
93	NC_009973	GCG	2	6	4143	4148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901514
94	NC_009973	CCG	2	6	4452	4457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901514
95	NC_009973	TGG	2	6	4548	4553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009973	TTA	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009973	AGC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009973	GCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009973	TGA	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901515
100	NC_009973	CTT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901515
101	NC_009973	CCT	2	6	4916	4921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159901515
102	NC_009973	CG	3	6	5037	5042	0 %	0 %	50 %	50 %	159901515
103	NC_009973	AGC	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
104	NC_009973	CAC	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
105	NC_009973	CCAAGG	2	12	5102	5113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
106	NC_009973	GGC	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159901515
107	NC_009973	GCCG	2	8	5151	5158	0 %	0 %	50 %	50 %	159901515
108	NC_009973	CCG	3	9	5180	5188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
109	NC_009973	CTG	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
110	NC_009973	GCA	2	6	5249	5254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
111	NC_009973	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159901515
112	NC_009973	CCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
113	NC_009973	AACC	2	8	5324	5331	50 %	0 %	0 %	50 %	159901515
114	NC_009973	CGC	2	6	5343	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
115	NC_009973	GCA	2	6	5423	5428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
116	NC_009973	TGC	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
117	NC_009973	AGC	2	6	5515	5520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
118	NC_009973	TGG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159901515
119	NC_009973	CAC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
120	NC_009973	AGC	2	6	5962	5967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
121	NC_009973	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
122	NC_009973	GA	3	6	6091	6096	50 %	0 %	50 %	0 %	159901515
123	NC_009973	GCC	2	6	6111	6116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
124	NC_009973	AGC	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
125	NC_009973	TGCCC	2	10	6182	6191	0 %	20 %	20 %	60 %	159901515
126	NC_009973	AGA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901515
127	NC_009973	CAG	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
128	NC_009973	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
129	NC_009973	CTCAAA	2	12	6357	6368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	159901515
130	NC_009973	GTC	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
131	NC_009973	CTG	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
132	NC_009973	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
133	NC_009973	CCG	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
134	NC_009973	CCA	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901515
135	NC_009973	GAA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159901515
136	NC_009973	TCG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901515
137	NC_009973	GCC	2	6	6825	6830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159901515
138	NC_009973	CGA	2	6	6863	6868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901515
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241	NC_009973	GCA	2	6	12720	12725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_009973	ATT	2	6	12842	12847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009973	CCA	2	6	12908	12913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
244	NC_009973	A	7	7	12921	12927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_009973	A	6	6	13621	13626	100 %	0 %	0 %	0 %	159901518
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264	NC_009973	TTC	2	6	13978	13983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901519
265	NC_009973	TGC	2	6	14088	14093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901519
266	NC_009973	CAA	2	6	14120	14125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901519
267	NC_009973	TTG	2	6	14139	14144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159901519
268	NC_009973	TTGG	2	8	14161	14168	0 %	50 %	50 %	0 %	159901519
269	NC_009973	AAAG	2	8	14176	14183	75 %	0 %	25 %	0 %	159901519
270	NC_009973	GCT	2	6	14194	14199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901519
271	NC_009973	ATG	2	6	14231	14236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901519
272	NC_009973	CGT	2	6	14258	14263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159901519
273	NC_009973	GTA	2	6	14333	14338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901519
274	NC_009973	TTA	2	6	14351	14356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159901519
275	NC_009973	GCA	2	6	14417	14422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901519
276	NC_009973	TTTA	2	8	14500	14507	25 %	75 %	0 %	0 %	159901519
277	NC_009973	TGCAT	2	10	14575	14584	20 %	40 %	20 %	20 %	159901519
278	NC_009973	AAC	2	6	14615	14620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901519
279	NC_009973	TG	3	6	14639	14644	0 %	50 %	50 %	0 %	159901519
280	NC_009973	AAC	2	6	14674	14679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159901519
281	NC_009973	GAT	2	6	14687	14692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159901519
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285	NC_009973	CGGT	2	8	14985	14992	0 %	25 %	50 %	25 %	159901519
286	NC_009973	GCA	2	6	15077	15082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159901519
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288	NC_009973	TGT	2	6	15133	15138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009973	A	6	6	15171	15176	100 %	0 %	0 %	0 %	159901520
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320	NC_009973	CAA	2	6	16857	16862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
321	NC_009973	AATA	2	8	16883	16890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_009973	CAT	2	6	16905	16910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_009973	CAA	3	9	16932	16940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_009973	CAA	2	6	16954	16959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
325	NC_009973	TATT	2	8	16960	16967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_009973	TAT	2	6	17040	17045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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336	NC_009973	ATT	2	6	17437	17442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_009973	TTTTA	2	10	17533	17542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
338	NC_009973	CTT	2	6	17672	17677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159901523
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381	NC_009973	ATGA	2	8	20170	20177	50 %	25 %	25 %	0 %	159901523
382	NC_009973	ATC	2	6	20236	20241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159901523
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387	NC_009973	TCA	2	6	20472	20477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_009973	CAA	2	6	20518	20523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_009973	GCTG	2	8	20533	20540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
390	NC_009973	ACG	3	9	20656	20664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_009973	CCAT	2	8	20682	20689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
392	NC_009973	CA	3	6	20743	20748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
393	NC_009973	GTC	2	6	20793	20798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_009973	ATC	2	6	20823	20828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_009973	CAC	2	6	20968	20973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159901524
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